A Escola de Aperfeiçoamento do Sistema Único de Saúde (EAPSUS), mantida pela Fundação de Ensino e Pesquisa em Ciências da Saúde (FEPECS) foi criada em 22 de agosto de 2013, pelo Decreto nº 34.593, teve seu Regimento Interno publicado pela Ordem de Serviço Nº 61 de 13 de setembro de 2022, no DODF Nº 178 de 21 de setembro de 2022.
Atualmente, a EAPSUS é dirigida pela servidora da SES-DF, Dra. Fernanda Ramos Monteiro, e possui em sua estrutura administrativa, três gerências e uma Secretaria de cursos, a saber: Gerência de Integração Ensino-Serviço gerida por Verônica Lobo Ferreira de Assis sendo responsável pelas atividades práticas curriculares, Gerência de Educação Permanente em Saúde gerida por Maiza Caroline Salles sendo responsável pelas atividades educativas presenciais e treinamento em serviço, Gerência de Tecnologias Educacionais em Saúde gerida por Elizabeth Moura Panisset Caiuby sendo responsável pelas atividades EAD e híbridas e Secretária de Cursos e de Integração Ensino-Serviço responsável por realizar ações administrativas relativas à secretaria.
